他们各自的优缺点是：
ZendOptimizer（Zend Guard）：
1、Zend Guard只能对带有PHP标记或源码的文件进行加密，对于其他不带有PHP标记的文本方式保存的文件不能进行加密操作
2、ZendGuard只能用于配置了ZendOptimizer的环境中，不能独立运行
3、ZendGuard在PHP4下的错误，对于PHP4的绝对路径及相对路径在加密时会出现较大的差别。
4、支持PHP4.2.X~5.2.X版本的加密
5、使用的ZendOptimizer（PHP引擎）可以提高源码20~50%以上的速度优化，结合ZendGuard可以提高至50%以上的性能速度 优化，且ZendOptimizer可以安装于当前较多主流系统中
ionCube：
1、ionCube不仅可以加密带有PHP标记或源码的php文件还可以对非php文件的以text方式保存的文件进行加密操作，如xml,js,css等。（但是读写时必须使用 ionCube所提供的读入API进行读写操作。）
2、ionCube在功能方面经过测试可以优胜于Zend公司的 ZendGuard，不仅支持期限，注册码，等加密方式，还支持对IP，MAC地址等复杂的加密方式
3、可加密的PHP版本从PHP4.0.6~5.2.X（比ZendGuard高2个级别）
4、ionCube与Zend一样，为了提高PHP性能优化也提供了相应的PHP引擎，可以为大多数操作系统提供PHP优化功能，但是可惜的是，至今未提供Windows版本的PHP引擎。
5、ZendGuard在PHP4下的错误，在ionCube中没有出现，可以看出ionCube相对稳定
6对于ionCube来说，对带有PHP标记或源码的文件采用压缩加密方式处理，对于非php的文本类文件则采用加密方式处理。在读入时必须使用 “ioncube_read_file/ ioncube_write_file”读写文件。因此在使用ionCube加密前需要对相应的PHP代码进行改造后才能使用。
ionCube官方:
http://www.ioncube.com/loaders.php
